由于新一代測序的出現(xiàn)，以及測序?qū)嶒?yàn)的成本飛速下降，大家對生物芯片的應(yīng)用和關(guān)注也在不斷下降，甚至有預(yù)言認(rèn)為，芯片技術(shù)面臨消亡。然而，全球著名投資銀行William Blair開展了一項(xiàng)關(guān)于生物芯片的調(diào)查，結(jié)果表明此技術(shù)在研究領(lǐng)域仍占有一席之地。

William Blair的分析員Amanda Murphy表示，盡管生物芯片技術(shù)目前主要局限于全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS），但“考慮到這些平臺之間的成本差異，我們相信芯片仍將在研究領(lǐng)域占據(jù)一席之地”。

她們預(yù)計(jì)，目前在芯片平臺上開展的很多應(yīng)用最終都將轉(zhuǎn)移至新一代測序平臺，然而，新一代測序的成本下降將放緩，因此，從芯片到測序這一轉(zhuǎn)移過程將比投資者們所預(yù)測的更加漫長。

William Blair開展了電子郵件調(diào)查，收到了84份反饋信息，隨后他們與GWAS以及在遺傳分析中使用芯片的領(lǐng)軍人物進(jìn)行了對話。這次調(diào)查的初衷是評估Illumina的芯片業(yè)務(wù)，但調(diào)查結(jié)果也透露了其競爭對手的情況。

盡管Illumina以測序業(yè)務(wù)聞名，但它最初是以生物芯片起家的，而芯片業(yè)務(wù)也占了總收入的35%。Murphy提到，GWAS成為Illumina芯片業(yè)務(wù)的關(guān)鍵推動者，它占了該公司芯片銷售額的四到五成。

然而到目前為止，GWAS只提供了疾病遺傳的有限信息，特別是對于復(fù)雜疾病，關(guān)于GWAS的價值，以及這些方法在確定疾病遺傳元件上的實(shí)用性，目前還存在很大爭議。因此，芯片公司開始在芯片上整合一些低頻率突變內(nèi)容，試圖克服GWAS的缺陷。

與一年前相比，Illumina第三季度的芯片業(yè)務(wù)下滑了9%，激發(fā)了人們對于芯片業(yè)務(wù)面臨淘汰的擔(dān)心。出現(xiàn)此問題的不僅僅是Illumina一家。Affymetrix過去一直被認(rèn)為是基因表達(dá)芯片的領(lǐng)頭羊，這幾年日子也不太好過。

William Blair此次的調(diào)查也證實(shí)了一些懷疑態(tài)度。55%的受訪者稱，他們不在開展GWAS。而54%的人員表示，他們預(yù)計(jì)明年的芯片使用將會持平。此外，隨著政府的資助縮減，也有人擔(dān)心芯片研究的資助還可能下降，89%目前使用芯片的受訪者稱，他們預(yù)計(jì)2013年的經(jīng)費(fèi)將會持平或減少，而70%的人表示，他們實(shí)驗(yàn)室暫無計(jì)劃再買一臺芯片儀器。

但是Murphy堅(jiān)持認(rèn)為，此技術(shù)將會在科研中占據(jù)一席之地，并提到一些領(lǐng)軍人物對外顯子芯片有著特別的興趣。在10月份召開的美國人類遺傳學(xué)會年會上，Illumina和Affy都推出了靶定外顯子組的芯片。這兩家公司認(rèn)為，這些產(chǎn)品能讓研究人員快速經(jīng)濟(jì)地驗(yàn)證大量樣品中的變異。

她預(yù)計(jì)芯片將會在應(yīng)用市場繼續(xù)使用，如診斷和農(nóng)業(yè)基因組學(xué)、歐洲群體之外的大規(guī)模GWAS研究，以及定向研究，如外顯子組芯片。“我們認(rèn)為今后兩年芯片收入都將穩(wěn)定，而不是買方預(yù)測的下降5%。”