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Illumina為中國人群推出“中華”芯片

來源:生物通 作者:秩名 責(zé)任編輯:admin 發(fā)表時(shí)間:2018-11-20 12:08 
核心提示:Illumina公司近日推出了一款HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片,特別覆蓋中國人特有的常見和稀有變異。 這款中華芯片特別地覆蓋了在中國人群體中發(fā)現(xiàn)的常見和稀有變異,適合全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。經(jīng)過優(yōu)化的標(biāo)簽SNP內(nèi)容來自HapMap所有三個(gè)階段以及千人

Illumina公司近日推出了一款HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片,特別覆蓋中國人特有的常見和稀有變異。

這款“中華”芯片特別地覆蓋了在中國人群體中發(fā)現(xiàn)的常見和稀有變異,適合全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。經(jīng)過優(yōu)化的標(biāo)簽SNP內(nèi)容來自HapMap所有三個(gè)階段以及千人基因組計(jì)劃(1kGP),經(jīng)過策略性選擇而創(chuàng)建出聚焦特定人群體的芯片,可用于在中國人種群中探索全新的疾病和性狀關(guān)聯(lián)。

由久經(jīng)考驗(yàn)的Infinium® HD分析技術(shù)所支持,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片將行業(yè)領(lǐng)先的數(shù)據(jù)質(zhì)量與高樣品通量和全面的基因組內(nèi)容相結(jié)合,而價(jià)格也極具吸引力。

全面的覆蓋

利用來自千人基因組計(jì)劃的最新內(nèi)容,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片覆蓋了中國人群體約81%的常見變異(r2 > 0.8),其次要等位基因頻率(MAF)> 5%。它的覆蓋度比競爭對手產(chǎn)品CHB特異的芯片(藍(lán)色)高了10%,如下圖所示。對于稀有變異(MAF > 2.5%),HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片覆蓋了約60%(r2 > 0.8),比競爭產(chǎn)品高出7%。比較得知,HumanOmniExpress-12芯片分別覆蓋了常見變異(MAF> 5%)和稀有變異(MAF > 2.5%)的75%和54%,這清晰表明HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片是中國人群GWAS研究的最佳起點(diǎn)。

久經(jīng)考驗(yàn)的Infinium質(zhì)量

Omni芯片家族是由全基因組Infinium® HD分析支持的。全世界的遺傳學(xué)研究人員都樂意采用Infinium HD分析,加速了疾病研究的新發(fā)現(xiàn),并積累了龐大的文獻(xiàn)記錄。HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片可實(shí)現(xiàn)對每個(gè)樣品進(jìn)行超過90萬個(gè)標(biāo)記物的圖譜分析。分析采用Illumina專利的BeadArray™技術(shù),可提供非常高的數(shù)據(jù)質(zhì)量,平均檢出率 > 99%,重復(fù)率 > 99.9%。高信噪比以及整體的低噪音水平可實(shí)現(xiàn)精確、可靠的檢出和拷貝數(shù)分析。

作為Omni家族的最新成員,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片是Illumina第一款人類種群特異的全基因組芯片。它包含了智能選擇的標(biāo)簽SNP,能全面覆蓋在中國人中發(fā)現(xiàn)的常見和稀有變異。在久經(jīng)考驗(yàn)的Infinium HD分析上獲得最新的千人基因組計(jì)劃內(nèi)容,以便加速您的中國人群GWAS研究。

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